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新的一年，普健生物（AtaGenix）持续为多项科研项目提供核心技术支撑，助力合作科研团队在前沿生命科学领域斩获新突破。近期，多篇合作成果相继登陆《Plant Communications》《Analytica Chimica Acta》等国际权威期刊，研究物种广泛覆盖龙眼、水稻、猕猴桃等多物种领域，尽显生命科学研究的多元拓展与深度探索。依托专业技术服务全程赋能，普健生物为科研成果的高效产出筑牢坚实保障，持续为科研创新注入强劲动力。
标题：Genomic and pan-genomic insight into longan domestication and improvement
龙眼作为重要热带水果，其遗传改良受限于完整基因组和泛基因组资源的缺乏。本研究组装了‘石硖’龙眼的端粒到端粒（T2T）无缺口基因组，完整解析了以 Gypsy-CRM 逆转录转座子为主的着丝粒结构，并整合 101 份龙眼材料的染色体水平基因组构建了图形化泛基因组。研究鉴定出 58978 个非冗余结构变异（SV），发现其在驯化和育种中存在选择性清扫信号；单倍型解析揭示 SV 和三维基因组结构可调控等位基因特异性表达。通过 SV-GWAS 定位到 12 个与成熟期相关的 QTL 位点，其中 DlDAZ 基因下游 758bp 插入可延迟果实成熟，转基因番茄实验验证了该基因的功能。该研究提供了全面的龙眼基因组资源，为解析关键农艺性状的分子机制及精准育种奠定了基础。
AtaGenix 为本研究定制并纯化了针对龙眼 CENH3 全长序列的兔源抗体，用于着丝粒特异性染色质免疫沉淀测序（CENH3 ChIP-seq）实验：通过特异性结合龙眼着丝粒区域的 CENH3 蛋白，富集相关染色质片段并测序，从而精准界定 15 条染色体的着丝粒位置及范围（大小 160kb-962kb）。为解析龙眼着丝粒的结构特征（如 Gypsy-CRM 逆转录转座子的富集）提供了关键工具。
标题：A cool temperature-induced ubiquitination-controlled transcription factor promotes starch degradation and ripening in kiwifruit
猕猴桃成熟对乙烯敏感，依赖乙烯催熟易导致过软，影响货架期，而低温调控淀粉降解的分子机制尚不明确。本研究发现 5–10℃的凉爽温度（CT）可独立于乙烯诱导猕猴桃淀粉降解和成熟。通过多组学分析鉴定出 CT 特异性诱导的 ERF 转录因子 AcCTS1，其可直接结合 AcBAM3.3 和 AcBAM3.5 的启动子并激活表达，促进淀粉水解。E3 泛素连接酶 AcPUB11 在常温下通过泛素化降解 AcCTS1，抑制淀粉降解；CT 条件下 AcPUB11 丰度降低，AcCTS1 积累并启动下游通路。转基因愈伤组织和果实实验验证了 AcPUB11-AcCTS1-AcBAM3s 模块的核心调控作用。该研究揭示了泛素化调控的温度响应机制，为猕猴桃采后品质调控提供了理论基础和技术支撑。
AtaGenix 为研究定制并纯化了针对 AcCTS1 和 AcPUB11 的兔源多克隆抗体。支持免疫印迹（Western blot）实验：通过特异性识别目标蛋白，精准检测 AcCTS1 和 AcPUB11 在不同温度条件下、不同基因型材料（野生型、过表达株系、敲除株系）中的蛋白丰度变化，验证了 “CT 下 AcPUB11 减少、AcCTS1 积累” 的关键调控关系。
标题：Engineering and Translational Evaluation of A Novel Albumin-binding Variable Domain of Heavy chain-only Antibody for Half-life Extension
治疗性蛋白半衰期短需频繁给药，影响患者依从性，白蛋白结合策略是延长半衰期的有效途径。本研究旨在开发新型白蛋白结合单域抗体（VHH），以卵泡刺激素（FSH）为模型验证其半衰期延长效果。通过噬菌体展示从羊驼天然 VHH 库中筛选出能交叉结合人血清白蛋白（HSA）和食蟹猴血清白蛋白（CSA）的候选分子，经 AlphaFold3 结构预测和丙氨酸扫描突变验证结合机制，优化获得 lead 分子 H2。将其与人源化 FSH 融合构建 FSH-m7，在人 FcRn 转基因小鼠和食蟹猴中均表现出显著半衰期延长（小鼠中达 50.08 小时，较野生型 FSH 提升 6.7 倍），且在幼年大鼠中保持剂量依赖性促卵巢发育和雌二醇升高活性。该研究建立了通用型白蛋白结合 VHH 平台，为治疗性蛋白的半衰期延长提供了高效解决方案。
AtaGenix 为研究提供了两项核心支撑：一是多样性达 1.51×10¹⁰ pfu 的羊驼天然 VHH 噬菌体展示库，二是高纯度（HSA≥99%、CSA≥98%）的人血清白蛋白（HSA）和食蟹猴血清白蛋白（CSA）抗原。VHH 库为筛选高亲和力白蛋白结合分子提供了核心资源，而高纯度同源和异源白蛋白抗原确保了筛选的特异性和跨物种结合活性验证的可靠性。通过该库筛选获得的 lead 分子 H2，其跨物种结合特性为后续食蟹猴药效学验证奠定了基础，直接支撑了“VHH平台具有临床转化潜力” 的核心结论。AtaGenix提供的标准化生物材料，保障了筛选实验的高效性和结果可信度，是整个半衰期延长平台开发的关键起点。
标题：Quantitative proteomics analysis of defense responses triggered by the Pi1 gene following Magnaporthe oryzae infection in rice
稻瘟病是威胁全球水稻生产的重大病害，Pi1 基因是赋予水稻广谱抗稻瘟病的关键基因，但 Pi1 介导的抗稻瘟病蛋白质组学机制尚不明确。本研究以感病水稻品系 MeiB 及其 Pi1 导入抗感系 96B 为材料，采用 TMT 定量蛋白质组学技术，分析稻瘟菌侵染 4 天后的差异表达蛋白（DEPs）。结果显示，96B 鉴定出 121 个 DEPs，MeiB 鉴定出 126 个 DEPs，两者均富集于代谢途径、次生代谢物合成等通路，但 96B 特有的 DEPs 富集于凋亡和嘌呤代谢通路。蛋白质相互作用网络分析表明，96B 形成了包含病程相关蛋白 PR10a 等 44 个蛋白的复杂网络，而 MeiB 仅含 22 个蛋白。研究证实，Pi1 基因通过调控凋亡 / 嘌呤代谢通路及蛋白质互作网络增强水稻抗稻瘟病能力，为解析 Pi1 介导的抗病机制提供了蛋白质水平证据。
AtaGenix为研究定制并纯化针对 3 个关键差异表达蛋白（B8BMF9、A2Z122、A2XUF3）的多克隆抗体，支撑 Western blot实验：通过特异性识别目标蛋白，验证了蛋白质组学鉴定的表达模式——B8BMF9和A2Z122在稻瘟菌侵染后上调，A2XUF3 下调，且结果与 TMT 定量数据一致，支撑了 “Pi1 基因调控特定蛋白表达参与抗病反应” 的核心结论。
标题：Myeloid CD209 impairs T-cell activation by inducing ICAM-2–ERM–dependent cortical stiffening
癌症免疫治疗中 “冷肿瘤” 对PD-1/PD-L1抑制剂响应率低，髓系细胞介导的免疫抑制是关键原因。本研究发现肿瘤浸润髓系细胞表达的 CD209（DC-SIGN）是新型机械免疫检查点，通过结合 T 细胞表面的 ICAM-2，激活 ERM 蛋白磷酸化，增加 T 细胞皮质硬度，破坏 T 细胞与抗原呈递细胞的稳定结合，抑制 TCR 信号传导。在人 CD209 敲入小鼠模型中，CD209 中和抗体可显著抑制卵巢癌、胶质母细胞瘤等多种肿瘤生长，促进 CD8⁺效应 T 细胞浸润和活化，与 PD-1 抑制剂联用具有协同作用。临床数据分析显示，CD209 高表达与 CD8⁺T 细胞浸润减少、PD-1 治疗耐药及患者不良预后相关。该研究揭示了 CD209 介导的免疫抑制新机制，为 “冷肿瘤” 免疫治疗提供了新靶点和伴随诊断标志物。
AtaGenix为研究定制并纯化了抗人 CD209 中和单克隆抗体。一是通过免疫接种重组 hCD209-ECD-Fc 蛋白，筛选出能特异性结合 CD209 并逆转其对人、鼠T细胞抑制作用的功能性抗体；二是为体内外实验提供高特异性工具，验证 CD209 阻断的抗肿瘤效果，包括体外恢复 T 细胞 IL-2 分泌、体内抑制肿瘤生长等关键实验。支撑了 “CD209 阻断可重激活抗肿瘤免疫” 的核心结论。
标题：Unlocking the Complexity of Macromolecular Protein Heterogeneity of Glycoprotein IgE via an Optimized Online Digestion Middle-Down Proteomics Approach
免疫球蛋白 E（IgE）作为介导过敏反应的关键糖蛋白，因分子量达 170~190 kDa 且含 7 个潜在 N - 糖基化位点，其蛋白异质性分析面临挑战。传统自上而下和自下而上蛋白质组学方法存在局限，本研究开发了优化的在线胃蛋白酶消化中尺度下蛋白质组学（MDP）平台。该平台通过可调参数生成 3-15 kDa 的高冗余肽段，成功实现 IgE 轻链 100%、重链 93% 的肽图覆盖率，解析了可变区超 80% 的序列，并鉴定出 6 个 N - 糖基化位点。研究揭示 Cε3 结构域存在 39 种糖蛋白亚型，明确了各位点糖型组成、占有率及微异质性，还通过整合数据注释了不同糖链数量的完整 IgE 蛋白亚型。该方法为大型异质性糖蛋白的全面表征提供了高效方案，对过敏疾病的诊断与治疗开发具有重要意义。
AtaGenix 为研究提供了在 HEK293 细胞中表达并纯化的重组 IgE 蛋白，作为实验的唯一目标分析物，支撑整个MDP平台的方法验证与 IgE 异质性解析：一是用于优化在线胃蛋白酶消化的关键参数（如酶量、温度、流速），确保生成符合 MDP 分析需求的肽段；二是为糖基化位点鉴定、糖型分析及蛋白亚型注释提供纯净、标准化的样本，避免杂蛋白干扰。支撑了 “MDP 平台可高效解析 IgE 复杂异质性” 的核心结论。
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