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每月研报:盘点普健生物2026年9月文献锦集

发表时间:2026-10-14 访问次数:16
九月,普健生物(AtaGenix)参与技术支持的多项研究相继发表。本月成果见刊于《Cell Death & Disease》《Cell Communication and Signaling》《Materials Today Bio》等国际学术期刊,研究方向涉及三阴性乳腺癌、胶质母细胞瘤、植物光合作用、花粉过敏、系统性红斑狼疮、沙贝病毒、草鱼呼肠孤病毒、爱德华氏菌、蜱传脑炎病毒、年龄相关性黄斑变性等领域,覆盖肿瘤、免疫、病原微生物和植物生物学等多个学科方向。在这些课题中,普健生物承担了从实验方案设计到数据交付的相关技术工作,配合课题组完成各阶段实验需求。以下为本月精选的部分研究成果。
01
Low-dose taxanes induce γδ-T cell reprogramming and ANXA6/PPP2R1A release to synergistically treat triple-negative breast cancer
期刊cell death & disease
影响因子IF 12.2
作者单位中山大学第一附属医院
三阴性乳腺癌(TNBC)缺乏明确的分子靶点,紫杉类化疗仍是主要手段,但受剂量依赖性毒性和耐药限制。γδ-T细胞可不依赖MHC直接杀伤肿瘤细胞,其在TNBC中的浸润水平与较好预后相关,但能否与紫杉类协同尚不清楚。该研究以TNBC细胞系及其紫杉醇耐药亚系、患者来源类器官和小鼠移植瘤模型为对象,结合转录组与蛋白组分析、基因敲低和体内治疗实验,发现低剂量紫杉醇和多西他赛在抑制肿瘤细胞增殖的同时并不损伤γδ-T细胞,反而促进其增殖并增强效应功能,两者联合在体内外均表现出协同抗肿瘤作用。机制上,紫杉类处理可诱导γδ-T细胞分泌ANXA6和PPP2R1A,二者在乳腺癌中高表达与较好生存相关,并富集于细胞死亡相关通路;敲低任一基因均削弱细胞上清的杀伤能力,外源补充重组蛋白可恢复活性,且两种蛋白能直接诱导TNBC细胞凋亡。在耐药细胞系、化疗难治患者来源类器官和耐药移植瘤模型中,该协同效应依然成立,并可清除肿瘤干细胞样细胞。研究认为低剂量紫杉类通过重编程γδ-T细胞实现化疗与免疫的协同,为克服TNBC耐药和降低化疗毒性提供了新思路。
AtaGenix提供了重组ANXA6蛋白(rANXA6)和重组PPP2R1A蛋白(rPPP2R1A),用于功能验证实验。两种蛋白主要承担三类用途:一是直接处理TNBC细胞和耐药TNBC细胞(rANXA6 0–10 μg/mL,rPPP2R1A 0–20 μg/mL,48小时),通过荧光素酶杀伤实验和Annexin V/PI染色评估其独立的抗肿瘤与促凋亡作用;二是作为回补实验的补充因子,在敲低ANXA6或PPP2R1A的γδ-T细胞条件培养基中外源加入,观察杀伤能力是否恢复;三是用于处理MDA-MB-231细胞后开展转录组测序,分析其下游通路。
02
Amino-acids-mTORC1-driven DDA1 phosphorylation promotes DNA repair and glioblastoma progression
期刊Cell Communication and Signaling
影响因子IF 11.6
作者单位呼吸健康与多病共存国家重点实验室
胶质母细胞瘤(GBM)是成人最常见的恶性脑肿瘤,mTORC1过度激活是其重要特征,但mTORC1如何将营养信号传递到细胞核内的DNA修复机器尚不清楚。DDA1是CRL4^CSA泛素连接酶复合物的调节亚基,参与转录偶联核苷酸切除修复,在多种肿瘤中上调,但作用机制不明。该研究以胶质瘤细胞系和原位移植瘤模型为对象,结合亲和纯化质谱、磷酸化蛋白质组、转录组和基因编辑分析,发现DDA1在溶酶体表面与mTORC1核心组分Raptor直接结合,但并不位于mTORC1上游;氨基酸刺激可诱导mTORC1依赖的DDA1第33位丝氨酸磷酸化,该修饰受RagA和Rheb双重调控,并在脊椎动物中高度保守。磷酸化后DDA1由胞质转入细胞核,与CRL4^CSA复合物的结合增强,促进紫外损伤后的核苷酸切除修复,而磷酸化缺失突变体无法恢复细胞克隆存活;转录组分析提示该通路还参与调控若干代谢基因的表达。体内实验中,敲除DDA1可抑制肿瘤生长、增加DNA损伤,并削弱肿瘤对营养补充的响应,临床数据库分析也显示DDA1高表达与预后不良相关。研究认为mTORC1–DDA1^S33–DNA修复轴将营养感知与基因组维持联系起来,可能成为胶质瘤的干预靶点。
AtaGenix在本研究中承担了抗DDA1 Ser33位点磷酸化特异性抗体的定制制备。该抗体贯穿全文的机制验证环节:用于证明氨基酸刺激可提高DDA1 Ser33磷酸化而Torin1将其消除、在RagA和Rheb敲除细胞中该磷酸化明显下降、检测核质分离样本中磷酸化DDA1的核内富集、在多株胶质瘤细胞中确认该磷酸化的普遍性,以及在原位移植瘤组织中验证体内通路激活。
03
OsCPK12-OsATPD1 Module Regulates Photosynthetic Acclimation to Light Stress in Rice
期刊Cell Communication and Signaling
影响因子IF 11.6
作者单位中国国家水稻研究所北方中心
光合作用中光反应与暗反应的协同是维持高效率和光保护的基础,但植物如何调控这一过程尚不清楚。钙依赖蛋白激酶(CPK)在逆境信号转导中作用广泛,作者前期发现水稻突变体oscpk12表现出对光强敏感的表型,提示其可能参与光适应调控。该研究以粳稻野生型、oscpk12突变体及OsAtpD1相关转基因株系为材料,结合蛋白互作验证、体外激酶反应、质谱、叶绿体分离和叶绿素荧光测定分析,发现突变体在强光下出现早衰,叶绿素含量、净光合速率和光系统II最大光化学效率下降,活性氧和丙二醛水平升高。机制上,OsCPK12与叶绿体ATP合酶δ亚基OsAtpD1互作,并磷酸化其转运肽上的一个丝氨酸位点;该位点突变为不可磷酸化形式后,OsAtpD1滞留于细胞质,而磷酸化模拟型可正常进入叶绿体。相应地,突变体、不可磷酸化型过表达株系及OsAtpD1干扰株系的ATP合酶活性、电子传递速率和跨膜质子梯度均降低,OsCPK12过表达株系则高于野生型,磷酸化模拟型过表达可回复突变体的早衰表型。研究认为,光诱导的OsCPK12通过磷酸化OsAtpD1促进其向叶绿体转运,维持ATP合酶活性与质子梯度稳态,实现光胁迫下的光合适应与光保护。
AtaGenix在文中承担了两项抗体相关的定制合成工作。一是合成OsAtpD1 Ser8位点的磷酸化肽段与对应的非磷酸化肽段,偶联匙孔血蓝蛋白后免疫家兔制备多克隆抗血清,作者再自行用亲和层析纯化得到抗pSer8抗体;二是合成全长OsAtpD1重组蛋白,作为免疫原用于制备抗OsAtpD1抗体。这两种抗体贯穿全文的关键证据环节:抗pSer8抗体先用于肽段点杂交验证自身特异性,再用于体外激酶反应中确认OsCPK12对Ser8的磷酸化、以及λ磷酸酶处理后信号消失的对照,随后在原生质体体系中证明内源水平的Ser8磷酸化只出现在ZH8015而非oscpk12-cr中;抗OsAtpD1抗体则用于检测OsAtpD1的蛋白丰度及其在总蛋白与叶绿体组分中的分配变化。
04
Engineering Tolerogenic mRNA-LNPs for Allergen-Specific Immune Reprogramming in Pollen Allergy
期刊Materials Today Bio
影响因子IF 11
作者单位大连理工大学化学工程学院
花粉过敏影响全球约三分之一人口,现有变应原免疫治疗存在疗效不稳定、可能诱发IgE介导的过敏反应以及难以建立持久耐受等问题。mRNA疫苗具有抗原可编程、降低IgE交联风险等优势,但其递送所依赖的脂质纳米颗粒本身具有佐剂活性,会带来非特异性炎症,不利于耐受建立。该研究同时从抗原序列和递送系统两方面改造:一方面设计去除信号肽、融合恒定链的非分泌型艾蒿主要变应原mRNA,使抗原在胞内经MHC II通路提呈;另一方面通过筛选PEG脂质链长并引入甘露糖修饰,获得低炎症、靶向抗原提呈细胞的递送制剂。结果显示,该制剂皮下给药后主要在肝脏表达,形成以调节性细胞因子升高为特征的局部耐受微环境,树突状细胞呈现MHC II高、共刺激分子低的耐受表型,脾脏中变应原特异性调节性T细胞扩增。在艾蒿花粉过敏小鼠的治疗和预防模型中,该疫苗均能减轻过敏症状和肺部炎症、降低特异性IgE并纠正IgG亚类比值。研究认为该平台可作为诱导变应原特异性免疫耐受的模块化策略,但耐受的持久性和因果机制仍需进一步验证。
AtaGenix在文中提供了重组艾蒿主要花粉变应原Art v 1蛋白(N端His标签)。该蛋白在实验中承担两类用途:一是作为蛋白对照组的免疫原,与mRNA疫苗组平行给药,用以比较传统重组蛋白免疫与mRNA-LNP在诱导调节性T细胞和肝脏耐受相关基因表达上的差异;在预防模型中还与AlOOH纳米棒配伍(rAr-AlOOH),作为传统佐剂疫苗的对照。二是作为体外再刺激抗原,用2 μg/mL刺激脾细胞和淋巴结细胞,以检测变应原特异性的T细胞反应,包括CD25、FoxP3、CTLA-4、Helios等Treg标志物和胞内细胞因子。此外,在细胞实验中它也作为游离蛋白对照,用于评估其对LSEC和树突状细胞表面MHC II、CD80、CD86的影响。
05
A proinflammatory FOLR2-positive macrophage subtype promotes cutaneous and renal damage in systemic lupus erythematosus
期刊JID
影响因子IF 7
作者单位中南大学湘雅二医院皮肤科
系统性红斑狼疮(SLE)是累及多器官的自身免疫病,适应性免疫异常研究较多,而巨噬细胞等固有免疫亚群在组织损伤中的作用尚不清楚。叶酸受体2(FOLR2)是其他炎症性疾病中促炎巨噬细胞的标志物,尿FOLR2水平也与狼疮肾炎及疾病活动度相关,但其功能未明。该研究整合公共单细胞和转录组数据、临床皮损与肾活检标本、狼疮小鼠模型及体外巨噬细胞实验,发现SLE皮损中真皮巨噬细胞总量与对照相当,但FOLR2阳性亚群明显扩增并成为优势亚群,盘状红斑狼疮中则无此现象;狼疮肾炎肾组织中该受体表达同样升高,皮损中其细胞密度与疾病活动度评分正相关。与健康来源细胞相比,SLE来源的FOLR2阳性巨噬细胞呈现多条炎症通路激活的促炎表型,经免疫复合物刺激后分泌更多促炎细胞因子、吞噬能力下降、抗原提呈和共刺激分子上调。研究进一步构建了叶酸靶向纳米载体,可选择性清除并失活该亚群,使小鼠自身抗体水平下降、皮损和肾脏病理减轻、尿白蛋白肌酐比改善,同时Th1/Th17比例下降、调节性T细胞增加,初步安全性良好。研究认为FOLR2阳性巨噬细胞是SLE中驱动皮肤和肾脏损伤的关键致病亚群,靶向清除可作为替代广谱免疫抑制的精准治疗思路。
AtaGenix在文中提供了重组RPLP0蛋白,用于体外构建免疫复合物。研究人员将从患者血清中纯化的抗RPLP0抗体与该重组蛋白按3 μg/μl等量于37 ℃孵育60分钟,形成RPLP0免疫复合物(IC),再用PBS、单独RPLP0蛋白、单独抗体和IC四组分别刺激人FOLR2阳性巨噬细胞24小时。该蛋白的作用是在体外重建狼疮皮损中的免疫复合物刺激环境,同时作为"仅有抗原"的对照组,用以区分免疫复合物的效应与抗原或抗体单独作用的效应。这组以重组RPLP0为核心的体外实验是唯一在功能层面验证该表型的环节,为后续靶向清除策略提供了机制依据。
06
Pangolin-derived sarbecoviruses show attenuated pathogenicity and transmissibility than SARS-CoV-2 in human ACE2 transgenic hamsters
期刊mBio
影响因子IF 5.4
作者单位广州医科大学第一附属医院
马来穿山甲体内已检出多种与SARS-CoV-2亲缘关系较近的沙贝病毒,但其致病性和跨种传播风险此前缺乏系统评估。该研究选取两株穿山甲来源冠状病毒MpCoV-GD和MpCoV-GX,与SARS-CoV-2平行比较,在人源细胞系、类器官和hACE2转基因仓鼠中开展分析。两株病毒在人源细胞和类器官中均可有效复制,但效率低于SARS-CoV-2,其刺突蛋白介导的膜融合能力也弱于后者。在仓鼠模型中,MpCoV-GD造成的肺部病理与SARS-CoV-2相近,表现为广泛的肺泡实质损伤,MpCoV-GX则主要引起轻度炎症浸润和肺泡壁增厚;两株病毒均可经直接接触和气溶胶途径传播,但气溶胶传播时感染性明显减弱。在防治评估中,瑞德西韦和莫努匹韦对两株病毒均有抑制作用,新冠康复者血清和灭活疫苗免疫小鼠血清可交叉中和两者;单克隆抗体S309具有广谱中和活性,而REGN10933和REGN10987仅对MpCoV-GD有效,原因在于MpCoV-GX受体结合域相关表位存在大量氨基酸替换。研究认为穿山甲来源沙贝病毒的致病性和传播能力总体弱于SARS-CoV-2,现有药物和免疫可提供一定交叉保护,但仍需持续开展野生动物病毒监测。
AtaGenix在文中提供了抗SARS-CoV-2刺突蛋白单克隆抗体S309,用于空斑减少中和试验(PRNT)。研究人员将该抗体与REGN10933、REGN10987两株已获批的治疗性单抗并列,分别与100 PFU的SARS-CoV-2或MpCoV-GD/-GX孵育后感染VeroE6细胞,通过空斑计数计算PRNT50,评估现有抗体对穿山甲来源病毒的交叉中和能力。结果显示,S309对两株穿山甲冠状病毒均具有良好的中和活性,而另外两株抗体仅对MpCoV-GD有效。该抗体在文章中的作用是作为广谱中和抗体的代表:S309识别的是刺突蛋白中较为保守的表位,与靶向受体结合域高变区的REGN系列抗体形成对照,正是这一对比使作者能够说明中和失败的原因在于表位序列差异,而非抗体本身效力不足。
07
Grass carp reovirus activates fish Ppp1r3g to suppress innate immunity and exacerbate hemorrhage via the 14-3-3ζ/Itgb3 signaling axis
期刊plos pathogens
影响因子IF 4.9
作者单位中国科学院水生生物研究所
草鱼呼肠孤病毒(GCRV)引起的出血病在草鱼和稀有鮈鲫中致死率高,主要表现为多组织大面积出血,减轻出血症状是提高存活率的关键。蛋白磷酸酶1调节亚基PPP1R3G此前主要在糖原合成和脂代谢领域被研究,其在鱼类固有免疫中的作用尚不清楚。该研究以草鱼肾细胞CIK、K562稳定表达细胞系、HEK293T细胞以及ppp1r3g敲除稀有鮈鲫和ppp1r3g嵌合草鱼为模型,结合免疫共沉淀-质谱、截短与定点突变、免疫组化和免疫荧光开展分析。结果显示,poly(I:C)和GCRV刺激可上调ppp1r3g表达,而敲低ppp1r3g抑制病毒复制并提高I型干扰素水平,提示Ppp1r3g通过与Rig-I、Mda5和Traf6互作负调控RLR通路。体内实验中,基因缺失鱼对GCRV的抗性明显增强、出血症状减轻,免疫相关基因表达上调。机制上,Ppp1r3g经其PP1c结构域的Ser36/37位点结合14-3-3ζ的EL17片段,而整合素β3(Itgb3)同样通过该片段与14-3-3ζ结合,二者存在竞争;Ppp1r3g还以剂量依赖方式经蛋白酶体途径促进Itgb3降解,从而阻碍14-3-3ζ–Itgb3复合物形成、抑制血小板活化和下游凝血级联。研究认为GCRV通过诱导Ppp1r3g同时抑制抗病毒免疫和凝血反应,加重出血症状,该轴可作为出血病防控的潜在靶点。
AtaGenix在文中提供了定制的抗14-3-3ζ抗体,用于三类检测:Western blot、免疫组化和免疫荧光。该抗体在文中用于检测内源14-3-3ζ的蛋白水平和组织分布:免疫组化显示GCRV感染后ppp1r3g敲除稀有鮈鲫卵巢组织中的14-3-3ζ阳性信号强于野生型,免疫荧光显示ppp1r3g嵌合草鱼肠道组织中的信号同样高于野生型。
08
The Edwardsiella T3SS effector EseJ enhances NF-κB signaling by stabilizing p65 and promoting TAK1 phosphorylation
期刊plos pathogens
影响因子IF 4.9
作者单位水生生物学研究所
爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)是一种感染多种经济鱼类并可引起人类感染的革兰氏阴性病原菌,其三型分泌系统(T3SS)通过向宿主细胞注射效应蛋白干预免疫信号,是致病的核心环节,但引发强烈炎症反应的具体效应蛋白及机制此前并不清楚。该研究以小鼠巨噬细胞系J774A.1、HEK293T细胞、黄颡鱼头肾原代白细胞和斑马鱼幼鱼为模型,结合基因缺失菌株、免疫共沉淀、泛素化分析和结构域截短等方法开展研究。结果显示,T3SS效应蛋白EseJ可激活NF-κB通路,促进IL-1β、IL-6等多种促炎细胞因子的转录与分泌,缺失eseJ的菌株诱导能力明显下降。机制上,EseJ通过两个独立结构域干预两条泛素依赖的调控环节:其N端1–242区段结合NF-κB亚基p65,阻止p65发生K48连接的多聚泛素化及蛋白酶体降解,从而维持较高水平的总p65和磷酸化p65,促进其入核和转录活性;中间区段(243–532)同时结合TAK1与TRAF6,作为分子支架稳定TRAF6–TAK1复合物,增强TRAF6介导的TAK1 K27连接泛素化,驱动TAK1磷酸化并激活下游IKK–IκB–NF-κB级联,抑制TAK1后该效应消失。斑马鱼感染实验证实EseJ在体内同样是炎症因子产生所必需。研究认为EseJ通过同时靶向p65和TAK1放大NF-κB依赖的炎症反应,鉴于其同源蛋白在其他革兰氏阴性菌中保守,该机制可能具有普遍性。
AtaGenix在文中提供了兔抗IL-1β单克隆抗体,以1:1000稀释用于Western blot。该抗体用于检测感染后宿主细胞中IL-1β的蛋白水平,包括前体pro-IL-1β和剪切后的成熟IL-1β。在黄颡鱼头肾原代白细胞感染实验中,作者用该抗体比较ΔfimH与ΔeseJΔfimH两株菌感染后的IL-1β水平,结果显示缺失eseJ的菌株诱导的p65总量、pro-IL-1β和cleaved IL-1β均明显低于对照株。
09
How Does Inter-Epitope Spacer Variation Within Artificial Immunogens Based on T-Cell Epitopes of Tick-Borne Encephalitis Virus Affect Immunogenicity?
期刊Vaccines
影响因子IF 3.5
作者单位俄罗斯病毒学与生物技术国家科学中心
蜱传脑炎病毒(TBEV)每年报告病例约一万至一万五千例,现有灭活疫苗主要诱导体液免疫,需多次接种且保护期有限,普遍认为与其激发的T细胞应答较弱有关。人工多表位免疫原是开发T细胞疫苗的可行方向,但连接表位的间隔序列如何影响免疫原性,此前多停留在理论预测,缺乏在同一表位组合内的系统比较。该研究从免疫表位数据库筛选黄病毒T细胞表位并与TBEV蛋白组比对,结合表位预测工具选出13段分别来自E、NS1、NS3和NS5蛋白的寡肽,按三种方式拼接成多表位免疫原:算法优选的含丙氨酸间隔序列、柔性GPGPG间隔序列以及不加间隔序列,三者均在N端融合泛素并构建成相应DNA疫苗。结构预测显示三种设计差异不大,但蛋白表达分析提示GPGPG型的加工方式明显不同,仅以降解产物形式存在。小鼠电穿孔免疫后,含丙氨酸间隔和无间隔两组均能诱导显著的IFN-γ分泌细胞应答,GPGPG组应答很低;三者均未产生针对E蛋白的抗体,符合其仅含T细胞表位的设计。研究认为间隔序列的选择显著影响多表位疫苗的免疫原性,GPGPG在该体系中并不适用,但相关结论目前仅限于单一品系小鼠模型。
AtaGenix在文中提供了用于刺激脾细胞的合成多肽,共18条,纯度均≥80%。这些肽段对应构建体中所含的TBEV蛋白表位,包括9聚体的MHC I类限制性肽和较长的MHC II类限制性肽,由NetMHCpan-4.1和NetMHCIIpan-4.0根据%Rank预测后交由AtaGenix合成。在实验中,这些肽以每条20 μg/mL的浓度混合成肽库,用于体外再刺激免疫小鼠的脾细胞,再通过ELISpot检测分泌IFN-γ的细胞数量。该环节是全文判定免疫原性的唯一读出方式:三组DNA疫苗之间的差异——AG1-ub和AG4-ub诱导显著应答、AG2-ub应答处于背景水平——完全依赖这组肽库的刺激结果;同时,由于所用肽段严格对应构建体内包含的表位,该检测反映的是抗原特异性T细胞应答,而非非特异性激活,这也是作者据以得出"间隔序列选择影响免疫原性"这一核心结论的实验基础。此外,由于这组肽只覆盖T细胞表位,它与使用重组E蛋白的ELISA形成互补,共同支持了构建体为T细胞导向这一判断。
10
Expression, Purification and Antioxidant Activity of Recombinant Human Vascular Endothelial Growth Factor B167 in Escherichia coli
期刊Protein Expression and Purification
影响因子IF 1.8
作者单位辽宁大学生命科学学院
年龄相关性黄斑变性(AMD)是老年人视力损害的主要原因,氧化应激被认为是其核心致病机制,目前仍缺乏有效的防治手段。VEGFB是VEGF家族中兼具抗氧化与神经保护作用的成员,其主要功能亚型VEGFB167占转录本八成以上,此前受原核表达产量偏低的限制,难以规模化制备。该研究以pBV220载体在大肠杆菌BL21中建立了不依赖IPTG的温度诱导表达体系,目的蛋白以包涵体形式高效积累,经镍亲和层析、复性和凝胶过滤后获得纯度约 97% 的活性蛋白;在过氧化氢诱导的视网膜色素上皮细胞氧化损伤模型中,VEGFB167 呈浓度依赖性地减轻细胞膜损伤和脂质过氧化、降低活性氧水平、提升抗氧化酶活性及相关基因表达,并抑制凋亡、恢复细胞的 DNA 复制与增殖能力。研究认为该流程可稳定制备有生物活性的 VEGFB167,为其作为氧化损伤相关疾病的候选治疗分子提供了实验基础,但现有证据仅来自体外细胞实验,上游受体与下游信号通路尚未阐明,体内有效性仍待验证。
AtaGenix承担了VEGFB167表达质粒的构建工作,包括基因合成、载体构建和质粒测序。研究人员根据CCDS数据库序列设计了带C端His标签的VEGFB167编码序列,针对大肠杆菌进行密码子优化,并在5'和3'端分别引入BamHI和EcoRI酶切位点,这些DNA合成与克隆工作由AtaGenix完成,所得质粒随后转化入BL21进行表达。后续的温度诱导表达、包涵体纯化、复性以及所有细胞功能实验都建立在这一质粒之上,其中的密码子优化关系到原核系统中的表达量,His标签则决定了镍柱纯化路线的可行性。

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